Descifran molécula contra el SIDA con videojuego On Line
Texto: Antimio Cruz Imagen: Foldit
Científicos que participaron en un videojuego en línea llamado Foldit lograron descifrar la estructura tridimensional de una proteína que es clave para desarrollar medicamentos antiretrovirales contra el Virus de Inmunodeficiencia Humana (VIH), causante del SIDA.
Resolver este rompecabezas bioquímico fue posible gracias a un reto que lanzó la Universidad de Washington, en Seattle, después de numerosos intentos de sus investigadores por tratar de averiguar el plegamiento o estructura cristalina de la molécula llamada M-PVM, que es una proteasa retroviral monomérica y que actúa en el momento en que el VIH se adhiere a las células sanas y les inyecta material genético.
Una pregunta lógica podría ser ¿por qué fue necesaria la participación de jugadores en línea para adivinar la arquitectura de una molécula si ya existen súper computadoras que procesan millones de datos en unos cuantos segundos?
Los creadores del videojuego Foldit explicaron que las computadoras no tienen las habilidades de pensamiento tridimensional que tienen los seres humanos y por ello es más fácil descubrir la estructura cristalina de una proteína si hay decenas o cientos de cerebros haciendo propuestas o sugerencias sobre la mejor manera como quedaría la estructura de una molécula.
Los modelos de solución que se propusieron en un periodo de tres semanas resolvieron algunos de los problemas que no tenían respuesta desde hace 10 años. El resultado final fue publicado en la revista científica Nature Structural & Molecular Biology.
“Tras el fracaso de una amplia gama de intentos por resolver la estructura cristalina de la M-PMV de proteasa retroviral por reemplazo molecular, desafiamos a los jugadores de Foldit para producir modelos precisos de la proteína, en su forma plegable”, explicó en la revista el líder del proyecto de investigación Firas Khatib, del Departamento de Bioquímica de la Universidad de Washington.
“Sorprendentemente, los jugadores Foldit fueron capaces de generar modelos de calidad suficiente para el reemplazo de éxito molecular y determinación de la estructura posterior. La estructura refinada ofrece nuevas perspectivas para el diseño medicamentos antirretrovirales”, añadió.
Extravagante videojuego
La palabra fold significa plegar y se usa para referirse al momento en que una molécula pasa de ser un estambre estirado, formado por aminoácidos, a un nudo o un enjambre que se repite cada vez que la proteína toma su forma cristalizada.
El videojuego en línea Foldit, es un software que consiste en predecir la estructura tridimensional que tendrán las proteínas cuando se pliegan. Lo único que se le da a los jugadores es la información de la secuencia de aminoácidos que forman la proteína. El propóstito del videojuego es encontrar, gracias a la intuición, suerte y ejercicio de prueba y error, la forma que tendría esa proteína en la naturaleza.
El programa fue creado en 2008 y abierto para los jugadores en línea, que prácticamente en todos los casos son químicos y bioquímicos. Sus creadores fueron investigadores de los departamentos de Bioquímica y de Informática de la Universidad de Washington. El desciframiento correcto de la estructura de la proteína M-PVM es su primer gran logro.
Científicos que participaron en un videojuego en línea llamado Foldit lograron descifrar la estructura tridimensional de una proteína que es clave para desarrollar medicamentos antiretrovirales contra el Virus de Inmunodeficiencia Humana (VIH), causante del SIDA.
Resolver este rompecabezas bioquímico fue posible gracias a un reto que lanzó la Universidad de Washington, en Seattle, después de numerosos intentos de sus investigadores por tratar de averiguar el plegamiento o estructura cristalina de la molécula llamada M-PVM, que es una proteasa retroviral monomérica y que actúa en el momento en que el VIH se adhiere a las células sanas y les inyecta material genético.
Una pregunta lógica podría ser ¿por qué fue necesaria la participación de jugadores en línea para adivinar la arquitectura de una molécula si ya existen súper computadoras que procesan millones de datos en unos cuantos segundos?
Los creadores del videojuego Foldit explicaron que las computadoras no tienen las habilidades de pensamiento tridimensional que tienen los seres humanos y por ello es más fácil descubrir la estructura cristalina de una proteína si hay decenas o cientos de cerebros haciendo propuestas o sugerencias sobre la mejor manera como quedaría la estructura de una molécula.
Los modelos de solución que se propusieron en un periodo de tres semanas resolvieron algunos de los problemas que no tenían respuesta desde hace 10 años. El resultado final fue publicado en la revista científica Nature Structural & Molecular Biology.
“Tras el fracaso de una amplia gama de intentos por resolver la estructura cristalina de la M-PMV de proteasa retroviral por reemplazo molecular, desafiamos a los jugadores de Foldit para producir modelos precisos de la proteína, en su forma plegable”, explicó en la revista el líder del proyecto de investigación Firas Khatib, del Departamento de Bioquímica de la Universidad de Washington.
“Sorprendentemente, los jugadores Foldit fueron capaces de generar modelos de calidad suficiente para el reemplazo de éxito molecular y determinación de la estructura posterior. La estructura refinada ofrece nuevas perspectivas para el diseño medicamentos antirretrovirales”, añadió.
Extravagante videojuego
La palabra fold significa plegar y se usa para referirse al momento en que una molécula pasa de ser un estambre estirado, formado por aminoácidos, a un nudo o un enjambre que se repite cada vez que la proteína toma su forma cristalizada.
El videojuego en línea Foldit, es un software que consiste en predecir la estructura tridimensional que tendrán las proteínas cuando se pliegan. Lo único que se le da a los jugadores es la información de la secuencia de aminoácidos que forman la proteína. El propóstito del videojuego es encontrar, gracias a la intuición, suerte y ejercicio de prueba y error, la forma que tendría esa proteína en la naturaleza.
El programa fue creado en 2008 y abierto para los jugadores en línea, que prácticamente en todos los casos son químicos y bioquímicos. Sus creadores fueron investigadores de los departamentos de Bioquímica y de Informática de la Universidad de Washington. El desciframiento correcto de la estructura de la proteína M-PVM es su primer gran logro.
